湛江市疾病预防控制中心成立于2002年底，是湛江市卫生局直属副处级卫生事业单位，是政府实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务单位。该中心主要负责组织实施辖区内的疾病预防控制计划、开展对重大疫情及传染病暴发流行的处理、实施计划免疫接种规划、开展疾病防治工作、开展从业人员预防性健康检查及卫生知识培训工作、负责卫生监测检验和卫生学评价、承担专项抽检及产品检验任务、承担突发公共卫生事件与违法案件的现场卫生学调查和采样检测、开展果菜无公害监测检验工作等。该中心现有人员编制172人，其中研究生4人、本科56人。专业技术人员123人，高级专业技术职称 22人（正高5人），中级职称58人。中心占地面积12000平方米，工作用房建筑面积9795.2平方米。实验室拥有原子吸收光谱仪、高效液相色谱仪、气相色谱仪、ICP-MS检测仪、柱后衍生分析仪、连续流动注射分析仪和全自动细菌鉴定与药敏分析系统、全自动凝胶成像系统、免疫荧光酶标检测仪、全自动蛋白印迹仪、全自动核酸提取仪、贾第鞭毛虫和隐孢子虫快速法检测仪等一批较先进的设备，常规检验和突发公共卫生应急检验检测能力不断提高，已建成能适应当前工作需要的区域性卫生检验中心，可开展食品、生活饮用水、公共场所、消毒效果监测及疾病控制类等300多个项目的检测。2006年被省确定为首批五个地市级艾滋病确证实验室之一，2008年10月通过实验室国家认可，2008年12月被确定为“广东省病原微生物监测和应急检测合作实验室”，2010年1月被确定为“广东省食品安全监测检测合作实验室”，同时积极参加全球沙门氏菌监测和新发与再发传染病监测等国际合作项目。到2012年下半年，生活饮用水检验能力可达到国家卫生标准规定的106项指标要求。

该中心成立以来，认真履行职责，加强疾病防控，全力以赴开展救灾防病，快速、高效处置暴发疫情和其他公共卫生事件，取得显著成绩：全市不明原因肺炎、人禽流感、霍乱、艾滋病、狂犬病、流感、登革热、手足口病、流脑、麻疹、AFP、新生儿破伤风、疟疾等传染病监测防控工作成效显著，近5年无发生登革热疫情，11年无发生霍乱流行；全市先后消灭血吸虫病、丝虫病，基本控制布鲁氏菌病、白喉病；连续17年保持无脊髓灰质炎状态，全市常规免疫接种率达90%以上，计免针对疾病发病率持续维持在较低水平，达到省规定要求；疟疾年发病率控制在0.2/10万以下；2010年全市如期实现消除碘缺乏病目标；食品安全、生活饮用水、公共场所和消毒效果等监测工作任务按时完成。由于工作成绩显著，中心先后获得“全国计划免疫先进单位”、“省抗非模范集体”、“省行风建设先进单位”、“省预防用生物制品管理先进单位”、“创建省级卫生城市先进单位”、“2011年广东省艾滋病防治主要措施落实质量奖”、“市行风满意单位”等荣誉称号。