惠州市疾病预防控制中心是2001年12月28日由惠州市、惠城区两级卫生防疫站撤并后组建的副处级事业单位（加挂“惠州市卫生检验中心”牌子），是全市疾病预防控制和卫生监测检验的技术指导与服务机构。该中心主要负责组织实施本辖区的传染病的预防与控制、艾滋病的预防与控制、“除四害”工作技术指导、承担各类公共场所及餐饮业的卫生学评价、开展职业病危害评价及健康检查、承担各大医学院校部分学生的带教任务及市政府和卫生行政部门的指令性工作任务等。该中心现有在职干部职工145人，其中博士学历1人，研究生学历4人，本科学历68人，大专学历43人。具有正高级技术职称7人，副高级技术职称21人，中级技术职称37人，初级技术职称52人。中心领导班子成员4人，设1正3副，另设1名主任助理，设有15个科室。

该中心拥有气—质联用仪、原子荧光光度计、离子色谱仪、原子吸收分光光度计、气相色谱仪、高效液相色谱仪、紫外可见分光光度计、倒置荧光数码显微镜、半自动生化分析仪、全自动细菌鉴定仪、全自动蛋白印迹仪、快速实时定量PCR仪、荧光定量PCR仪、流式细胞仪等仪器设备。该中心通过CNAS国家实验室认可和广东省实验室资质认定，并获得广东省职业卫生技术服务机构资质、广东省职业健康检查机构和建设项目职业病危害评价的资质；广东省公共场所集中空调通风系统卫生学评价资质；广东省病原微生物监测和应急检测合作实验室，艾滋病病毒抗体检测确证实验室，国家流感监测网络实验室，广东省肠道病毒核酸检测实验室，广东省麻疹网络实验室。